A região onde está a Rodoviária de Botucatu é área de várzea da bacia do Córrego Água Fria, por isso recebe elevado nível de águas pluviais em dias de fortes chuvas. A população deve evitar transitar pelo local em dias de fortes chuvas e jamais tentar atravessar a via caso esteja encoberta pela água.

A área já foi sinalizada pela Defesa Civil com placas e pela SEMUTRAN com proibição de estacionamento e o nível dos rios são monitoradas 24 horas por dia pela Defesa Civil do Município. Quando há fortes chuvas e possibilidade de alagamento, equipes da Defesa Civil e Prefeitura se mobilizam para fechar a passagem de veículos e evitar acidentes e danos.

Em caso de emergência, a população pode acionar a Defesa Civil pelo telefone 199. Neste ano, pelo menos 14 imoveis foram atingidos por alagamentos, segundo divulgou a Defesa Civil de Botucatu.